Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna7P49582 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms