Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtpreP49446 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtpreP49446 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtpreP49446 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtpreP49446 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtpreP49446 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtpreP49446 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtpreP49446 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtpreP49446 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtpreP49446 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtpreP49446 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtpreP49446 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PtpreP49446 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtpreP49446 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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