Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl11P48298 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms