Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tac1P41539 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tac1P41539 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tac1P41539 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tac1P41539 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tac1P41539 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tac1P41539 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms