Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxrgP28705 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxrgP28705 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxrgP28705 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxrgP28705 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RxrgP28705 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RxrgP28705 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxrgP28705 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxrgP28705 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxrgP28705 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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