Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxraP28700 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxraP28700 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxraP28700 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxraP28700 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RxraP28700 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxraP28700 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RxraP28700 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RxraP28700 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RxraP28700 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxraP28700 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxraP28700 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxraP28700 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RxraP28700 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxraP28700 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxraP28700 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxraP28700 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxraP28700 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxraP28700 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxraP28700 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxraP28700 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxraP28700 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxraP28700 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxraP28700 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxraP28700 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxraP28700 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxraP28700 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RxraP28700 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxraP28700 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxraP28700 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxraP28700 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxraP28700 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxraP28700 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxraP28700 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxraP28700 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxraP28700 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxraP28700 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxraP28700 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxraP28700 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxraP28700 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxraP28700 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxraP28700 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxraP28700 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxraP28700 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxraP28700 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RxraP28700 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxraP28700 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxraP28700 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxraP28700 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxraP28700 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxraP28700 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxraP28700 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxraP28700 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxraP28700 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxraP28700 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxraP28700 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxraP28700 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxraP28700 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxraP28700 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxraP28700 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxraP28700 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxraP28700 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxraP28700 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RxraP28700 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RxraP28700 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxraP28700 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxraP28700 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxraP28700 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxraP28700 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxraP28700 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxraP28700 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxraP28700 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxraP28700 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxraP28700 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxraP28700 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxraP28700 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxraP28700 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxraP28700 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms