Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms