Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms