Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms