Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NdnP25233 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NdnP25233 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NdnP25233 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NdnP25233 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NdnP25233 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NdnP25233 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NdnP25233 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NdnP25233 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NdnP25233 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NdnP25233 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NdnP25233 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NdnP25233 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NdnP25233 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NdnP25233 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NdnP25233 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NdnP25233 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NdnP25233 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NdnP25233 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NdnP25233 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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