Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5bP21271 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5bP21271 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5bP21271 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5bP21271 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5bP21271 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5bP21271 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5bP21271 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5bP21271 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5bP21271 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5bP21271 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5bP21271 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5bP21271 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5bP21271 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo5bP21271 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo5bP21271 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo5bP21271 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo5bP21271 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo5bP21271 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo5bP21271 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms