Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms