Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms