Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms