Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpraP18052 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpraP18052 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpraP18052 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpraP18052 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpraP18052 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpraP18052 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtpraP18052 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtpraP18052 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtpraP18052 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms