Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcnaP17918 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcnaP17918 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcnaP17918 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcnaP17918 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms