Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms