Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms