Protein–RNA interactions for Protein: P07903

Ercc1, DNA excision repair protein ERCC-1, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc1P07903 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc1P07903 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ercc1P07903 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ercc1P07903 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ercc1P07903 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ercc1P07903 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ercc1P07903 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc1P07903 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc1P07903 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc1P07903 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc1P07903 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc1P07903 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms