Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtrP07309 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtrP07309 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtrP07309 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtrP07309 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtrP07309 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtrP07309 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtrP07309 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtrP07309 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TtrP07309 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtrP07309 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtrP07309 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtrP07309 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtrP07309 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtrP07309 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtrP07309 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtrP07309 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TtrP07309 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtrP07309 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtrP07309 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtrP07309 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtrP07309 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtrP07309 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtrP07309 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtrP07309 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtrP07309 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtrP07309 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TtrP07309 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtrP07309 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtrP07309 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtrP07309 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtrP07309 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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TtrP07309 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtrP07309 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtrP07309 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtrP07309 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtrP07309 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtrP07309 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtrP07309 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtrP07309 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtrP07309 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtrP07309 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtrP07309 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtrP07309 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtrP07309 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtrP07309 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtrP07309 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtrP07309 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtrP07309 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtrP07309 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtrP07309 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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