Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms