Protein–RNA interactions for Protein: P03953

Cfd, Complement factor D, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfdP03953 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CfdP03953 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CfdP03953 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CfdP03953 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CfdP03953 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CfdP03953 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CfdP03953 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CfdP03953 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CfdP03953 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CfdP03953 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CfdP03953 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CfdP03953 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CfdP03953 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CfdP03953 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CfdP03953 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CfdP03953 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CfdP03953 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CfdP03953 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CfdP03953 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CfdP03953 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CfdP03953 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CfdP03953 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CfdP03953 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CfdP03953 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CfdP03953 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CfdP03953 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CfdP03953 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CfdP03953 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CfdP03953 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CfdP03953 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CfdP03953 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CfdP03953 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CfdP03953 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CfdP03953 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CfdP03953 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CfdP03953 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CfdP03953 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CfdP03953 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CfdP03953 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CfdP03953 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CfdP03953 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CfdP03953 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CfdP03953 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CfdP03953 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CfdP03953 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CfdP03953 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CfdP03953 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CfdP03953 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CfdP03953 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CfdP03953 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CfdP03953 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CfdP03953 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CfdP03953 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CfdP03953 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CfdP03953 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CfdP03953 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CfdP03953 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CfdP03953 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CfdP03953 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CfdP03953 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CfdP03953 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CfdP03953 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CfdP03953 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CfdP03953 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CfdP03953 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CfdP03953 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CfdP03953 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CfdP03953 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CfdP03953 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CfdP03953 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CfdP03953 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CfdP03953 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CfdP03953 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CfdP03953 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CfdP03953 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CfdP03953 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CfdP03953 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CfdP03953 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CfdP03953 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CfdP03953 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CfdP03953 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms