Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms