Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01672 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
P01672 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01672 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01672 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01672 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01672 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01672 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01672 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01672 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01672 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01672 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01672 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01672 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01672 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01672 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01672 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01672 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01672 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01672 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01672 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01672 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P01672 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01672 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01672 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01672 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01672 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01672 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01672 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01672 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01672 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01672 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01672 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01672 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01672 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01672 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01672 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01672 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01672 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P01672 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01672 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01672 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01672 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01672 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01672 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01672 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01672 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01672 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01672 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01672 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01672 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01672 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01672 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01672 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01672 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms