Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccl20O89093 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ccl20O89093 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ccl20O89093 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ccl20O89093 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ccl20O89093 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Ccl20O89093 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Ccl20O89093 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Ccl20O89093 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Ccl20O89093 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Ccl20O89093 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Ccl20O89093 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Ccl20O89093 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ccl20O89093 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ccl20O89093 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ccl20O89093 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ccl20O89093 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ccl20O89093 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms