Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly86O88188 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly86O88188 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ly86O88188 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ly86O88188 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ly86O88188 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ly86O88188 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms