Protein–RNA interactions for Protein: O70138

Mmp8, Neutrophil collagenase, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp8O70138 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp8O70138 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp8O70138 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms