Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26a1O55127 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms