Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms