Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms