Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DffaO54786 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DffaO54786 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DffaO54786 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DffaO54786 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DffaO54786 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DffaO54786 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DffaO54786 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DffaO54786 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DffaO54786 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DffaO54786 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DffaO54786 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DffaO54786 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DffaO54786 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DffaO54786 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DffaO54786 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DffaO54786 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DffaO54786 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DffaO54786 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DffaO54786 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DffaO54786 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DffaO54786 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DffaO54786 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DffaO54786 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DffaO54786 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DffaO54786 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DffaO54786 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DffaO54786 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DffaO54786 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DffaO54786 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DffaO54786 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DffaO54786 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DffaO54786 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DffaO54786 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DffaO54786 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DffaO54786 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DffaO54786 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DffaO54786 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DffaO54786 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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DffaO54786 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DffaO54786 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DffaO54786 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DffaO54786 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DffaO54786 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DffaO54786 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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DffaO54786 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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DffaO54786 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DffaO54786 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DffaO54786 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DffaO54786 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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DffaO54786 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DffaO54786 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DffaO54786 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DffaO54786 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
DffaO54786 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DffaO54786 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DffaO54786 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DffaO54786 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DffaO54786 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DffaO54786 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DffaO54786 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DffaO54786 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DffaO54786 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DffaO54786 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DffaO54786 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DffaO54786 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DffaO54786 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DffaO54786 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DffaO54786 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DffaO54786 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DffaO54786 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DffaO54786 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DffaO54786 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
DffaO54786 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DffaO54786 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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