Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp100O35892 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp100O35892 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp100O35892 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Sp100O35892 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Sp100O35892 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms