Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms