Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd2O35392 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms