Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnih1O35372 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnih1O35372 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cnih1O35372 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnih1O35372 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnih1O35372 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih1O35372 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih1O35372 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih1O35372 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih1O35372 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih1O35372 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih1O35372 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih1O35372 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih1O35372 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih1O35372 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih1O35372 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih1O35372 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih1O35372 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih1O35372 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih1O35372 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih1O35372 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih1O35372 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih1O35372 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnih1O35372 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih1O35372 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih1O35372 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih1O35372 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih1O35372 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih1O35372 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih1O35372 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih1O35372 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih1O35372 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnih1O35372 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih1O35372 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih1O35372 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih1O35372 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnih1O35372 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih1O35372 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih1O35372 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih1O35372 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih1O35372 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih1O35372 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnih1O35372 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnih1O35372 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnih1O35372 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih1O35372 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih1O35372 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih1O35372 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih1O35372 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih1O35372 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnih1O35372 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms