Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms