Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpaO35216 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpaO35216 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpaO35216 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpaO35216 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpaO35216 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpaO35216 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpaO35216 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpaO35216 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpaO35216 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpaO35216 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpaO35216 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpaO35216 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpaO35216 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpaO35216 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms