Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe40O35185 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms