Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx3O35160 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx3O35160 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms