Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3cO35066 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms