Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17078M0QW51 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17078M0QW51 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms