Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ14

Gm4791, Predicted gene 4791, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4791J3QQ14 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4791J3QQ14 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4791J3QQ14 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4791J3QQ14 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4791J3QQ14 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4791J3QQ14 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4791J3QQ14 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4791J3QQ14 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4791J3QQ14 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4791J3QQ14 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4791J3QQ14 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm4791J3QQ14 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm4791J3QQ14 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm4791J3QQ14 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm4791J3QQ14 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm4791J3QQ14 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm4791J3QQ14 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm4791J3QQ14 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm4791J3QQ14 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4791J3QQ14 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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