Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm30655-201ENSMUST00000220498 1383 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms