Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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