Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms