Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20834J3QM72 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20834J3QM72 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms