Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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