Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms