Protein–RNA interactions for Protein: G3X9B4

4933408B17Rik, MCG121508, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933408B17RikG3X9B4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933408B17RikG3X9B4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933408B17RikG3X9B4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms