Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms